En el programa de gestión del conocimiento y la innovación, AEUN publicó tres libros:
- AEUN. (1988). Tasas de interés crecimiento económico y empleo. Bogotá: Universidad Nacional
- AEUN. (2009). Diálogo de la Economía con otras ciencias. Bogotá: Universidad Nacional Colombia. Diálogo de la Economía con otras ciencias – ISBN 978-958-99143-0-4
- Está en curso la edición del libro: Complejidad, Futuros y Planeación. Bogotá 2020.